西安交通大学第二附属医院消化内科创建于上世纪60年代，经过60年的艰苦创业，已成为集临床、科研、教学为-体的综合学科，现为卫生部国家临床重点专科、国家临床药理基地、陕西省优势医疗学科、陕博西省消化疾病质量控制中心、陕西省胃肠疾病研究中心、陕西省胃肠动力疾病重点研究室、1士后流动站、胃肠动力疾病培训中心、陕西省优质护理服务示范科室、陕西省消化专业护士培训基地。
消化科承担国家自然科学基金、国家支撑计划子课题及国家卫健委临床重点学科基金15项，教育部骨干教师基金1项，教育部博士点基金1项，陕西省科委科研各项基金30余项获教育部科技进步一等奖1项，陕西省和西安市科技进步奖6项。
主编专著18本，参编专著25部，获国家专利15项；发表论文900余篇，SCI收录180余篇，培养博士、硕士生数百名，毕业学生已遍及全国各地。
消化专科现有医护人员100余人，教授10人，副教授10人，博士导师3人，医生中有博士学位的占到80%以上，80%以上医生曾在国外留学学习，护士60%以上为本科学历。科室技术力量雄厚、梯队结构合理。与美国、日本、德国等发达国家的多家医院或学校建立了长期合作交流关系。
消化科设有3个病区，130张病床，有消化专家门诊、消化专科门诊、消化内镜中心、消化介入治疗室、胃肠动力疾病研究室、消化疾病研究所等。月门诊量9000人次左右，月住院病人近6000人次。