重庆大坪医院胃结直肠外科是集医、教、研为一体的国家重点学科，全军便秘诊治中心、肥胖与糖尿病国际卓越联盟（IEF）分中心。博士学位授予单位，博士后流动站。重庆市青年文明号单位。科室有教授6人。博士后2人，博士8人，硕士6人。开展床位70张。包括微创胃结直肠外科治疗、糖尿病及减重外科、疝外科、电子肠镜检查中心、盆底功能检测中心等。科室以结直肠肿瘤、胃肠肿瘤等常见病为工作重点，形成了腹腔镜、内镜、经肛门显微内镜“三镜”联合的全方位微创胃结直肠外科平台。在结直肠肿瘤、肥胖与糖尿病、顽固性便秘的外科治疗与研究方面形成了鲜明的专科特色、处于国内领先地位。结直肠肿瘤的手术根治率、5年生存率达国内先进水平；开展了各种保肛手术，使直肠癌保肛率达85％以上。胃癌的腹腔镜D2根治性切除术及各种扩大根治手术、极大提高胃癌患者的生存率。糖尿病的腹腔镜微创治疗缓解率达90%。开展功能性直肠悬吊术、盆底修复术、经阴道直肠前突修补术、结肠（次）全切除术治疗各种慢性顽固性便秘国内领先。同时开展了各种疝气的腹腔镜手术修补等。近年开展的经肛门内镜显微外科手术，糖尿病及减重外科、单孔结直肠癌根治术、以及经自然腔道结直肠癌根治术为学科发展开拓了新的方向。