巴中市中心医院儿科，成立于建院之初，系“四川省儿科重点专科”、“国家级住院医师规范化培训儿科基地”、“巴中市危重新生儿救治中心新生儿围产医学专科培训基地”、“巴中市医学会儿科专委会挂靠科室”，“巴中市儿科医学质量控制中心挂靠科室”，重庆医科大学附属儿童医院定点技术指导科室。科室设置有普儿内科、新生儿科、儿内外科门诊、儿保门诊、儿科全时段急诊、新生儿重症监护病房（NICU）、儿童重症监护病房（PICU）。目前儿内科病房开放床位64张，新生儿病房开放床位50张，PICU开放床位10张，门诊设有留置观察床位10张。承担了巴中市三县三区儿童的主要医疗救治任务。全科拥有医护人员共70人，其中副主任医师、副教授4人，主治医师13人，住院医师5人，副主任护师3人，主管护师11人，护师33人，护士1人。中华医学会四川省儿科专委会委员1人，四川省医师协会儿科重症医师分会常委1人，四川省医师协会儿科专委会委员1人，四川省医师协会新生儿分会委员1人，四川省围产医学专委会委员1人，四川医学会儿科专委会小儿肾病学组委员1人，四川省妇幼保健协会儿科分会委员1人。巴中市儿科专委会主任委员1人，副主任委员2人；四川省省级婴幼儿照护服务专家1人。科室医护人员先后至北京儿童医院、上海儿童医学中心、四川大学华西附二院、重庆医科大学附属儿童医院、西南医科大学附属医院、第三军医大学新桥医院、四川省人民医院等上级医院经过专业培训，形成了集医、教、研为一体的专业队伍。科室拥有先进的转运及抢救设备，配备有儿童有创/无创及高频呼吸机、经鼻高流量湿化加压氧疗仪、亚低温治疗毯、T组合复苏器、输血泵、德国耶格尔肺功能检测仪、儿童及婴儿高压氧舱、FeNO检测仪、儿童骨密度测定仪、微量血气分析仪、PCT检测仪等高端治疗检测设备，并配备进口超声雾化机、多功能监护仪、婴儿培养箱及转运暖箱、红外辐射抢救台、经皮胆红素测定仪、微量输液泵、微量推注泵、蓝光治疗箱、振动排痰仪等各类诊治设备达200多台件。熟练开展呼吸机支持治疗、胸腔闭式引流、腰椎穿刺、超早产儿的救治、早产儿袋鼠式护理、新生儿头颅彩超、早产低体重儿脐静脉置管、PICC置管、有创动脉血压监测、经皮CO2分压的监测、大便还原糖实验、呼吸道各类病原体DNA检测、哮喘的规范化治疗等各种现代化的医疗技术，成功挽救了许多危重患儿的生命。儿童预防保健开展了视力筛查、听力筛查、高危儿早期干预、性早熟干预、注意力多动障碍诊治等儿保项目，也开展了丹佛发育筛查（DDST）、图片词汇测试（PPTV）、词汇手势、词汇句子、孤独症行为筛查（ASD）各种筛查项目，更将该市儿童的卫生健康工作提升至预防为主、防治结合的水平。科室自2013年来逐步建立四川省住院医师规范化培训儿科基地，高要求、严标准的完成对基地学员的培训工作。同时还长期承担川北医学院、成都医学院、达州职业技术学院等医学院学生的临床教学任务。承担了巴中市基层医院医务人员的进修培训工作，为基层培养了一大批专业骨干。近年在国家级、省级刊物上发表专业论文多篇。