吉林医药学院附属医院妇产科属省级重点专科，科室设备精良、技术先进、服务一流，集医疗、教学、科研于一体。科室在岗医护人员30余人，其中高级职称6名，硕士研究生7名，科室技术骨干以中青年为主。科室拥有阴道镜、腹腔镜、宫腔镜等先进的诊疗设备。开设妇科门诊、产科门诊和定期的专家门诊。

妇科专业于2001年率先在吉林地区利用腹腔镜、宫腔镜的微创技术治疗子宫肌瘤、卵巢肿瘤、生殖系统畸形、不孕症、子宫腺肌病、卵巢巧克力囊肿、子宫脱垂等多种疾病。对宫颈癌、内膜癌及卵巢恶性肿瘤等治疗具有规范化、人性化、个体化治疗特色。

产科专业可开展Dolar（陪伴式）分娩、各种自由体位的分娩、新生儿抚触、游泳、产后康复等母婴保健技术。开办孕妇学校，开展胎儿畸形筛查，对妊娠合并的高血压、糖尿病等并发症具有成熟的诊疗技术。