南京医科大学第二附属医院肿瘤科是江苏省临床重点专科，“十四五”江苏省医学重点学科建设单位，江苏省癌痛规范化治疗示范病房，国家药物临床试验肿瘤专业机构，南京护理学会静脉治疗专科护士培训基地，南京医科大学硕/博士学位授予点和博士后流动站，中国抗癌协会中西医整合肿瘤专委会肺癌学组组长单位，江苏省抗癌协会肿瘤靶向治疗专委会主委单位‌。

科室现有床位90张，拥有医护人员55人（其中医生20人，护士35人），其中，主任医师8名，副主任医师3名；教授2名，副教授2名；博士生导师2名，硕士生导师5名‌。科室累计获得国家自然科学基金17项，其他省厅级课题19项，江苏省医学领军人才1名、江苏省医学重点人才1名、江苏省“六大高峰”人才、江苏省“333”高层次人才等各类省级人才13人次，累计发表SCI论文200余篇。获得江苏省科学技术奖二等奖1项、三等奖2项、江苏省医学新技术引进奖一等奖5项，二等奖5项，省厅级科技成果奖10余项。参与编写了3部教材，副主编了1部专著，发明专利5项‌。

科室常规开展各类实体肿瘤的诊断、治疗及全程管理，包括CT引导下经皮肺、肝等穿刺活检诊断，化疗、放疗、分子靶向治疗、免疫治疗、内分泌治疗、腹腔热灌注化疗、中西医结合抗肿瘤治疗、癌痛规范化治疗、安宁疗护、营养支持、多学科联合会诊（MDT）下的个体化综合治疗。此外，还开展一系列新技术，包括：布拉格治疗、射频消融、Ommaya囊侧脑室灌注化疗、同步放化疗联合免疫的新辅助治疗等，参与了多个国内多中心临床药物试验，发起多项研究者发起的临床研究。