南京医科大学第二附属医院呼吸科是江苏省临床重点专科，国家临床药理研究基地、呼吸病学博士学位授予点。现有床位94张，医师21人，教授、主任医师5人，副教授、副主任医师10人。其中博士研究生导师1名，硕士研究生导师3名，博士7名，硕士10名。在呼吸系疑难病与危重症如肺结节病、肺部恶性肿瘤、肺曲霉菌病、弥漫性肺泡出血、肺结缔组织病、重症肺部感染及ARDS等具备精准诊断与高效专业救治能力；近年来，学科在肺部感染、气道炎性疾病、睡眠呼吸障碍疾病等方向基础与临床研究成绩显著，承担国家自然科学基金面上项目6项、江苏省“六大高峰”人才、江苏省自然科学基金等科技项目多项，发表研究论文近180余篇，包括SCI论文50余篇，主编和参编科普著作、学术专著和高校教材4部；获江苏省科技进步奖、江苏省卫健委新技术引进奖多项。