南京市第一医院儿科，成立于1954年，儿科设有普通门诊、隔离门诊、儿科专家门诊、儿童哮喘专科门诊、儿科急诊、儿科病房、儿科留观病房及儿科输液室。在南院、西院、东院开设儿科普通门诊。儿科医护人员61人（包括退休反聘人员），拥有一批临床及教学经验丰富的专家，技术精湛，拥有完善的检查及治疗手段。对儿童各个系统常见病及疑难杂症有较高的诊治水平。同时承担着南京医科大学本科生及研究生、留学生的教学；每年发表核心期刊的论文数十篇。承担省级科研多项。

儿科病房宽敞、明亮，设有床位52张；儿科门诊集普通门诊、专家门诊、哮喘专科门诊、急诊、输液室、留观病房为一体，隔离门诊及输液在独立区域。设有留观床位6张。周一至周六设有专家门诊，急诊24小时开诊。年均门急诊量约12万人次，年均收治病人约2300人次。

儿科专科技术特色：

1、呼吸系统：对呼吸道感染性疾病可进行病原学检测及各种治疗，开展过敏原检查、脱毛敏治疗、儿童肺功能及呼出一氧化氮检测检查。开展雾化吸入治疗。

2、心血管疾病：对小儿先天性心脏病、心律失常、心肌炎进行诊断治疗，协助南京市第一医院心内科进行多种先天性心脏病、心律失常的介入治疗。

3、消化系统疾病：对慢性胃炎及溃疡病病原学诊断及系统治疗，开展呼出气幽门螺旋杆菌检测、轮状病毒检测，尿半乳糖检查。中药经皮给药治。

4、感染性疾病：通过多种检查明确病原，具备各种抗感染及支持、对症治疗方法。

5、内分泌免疫性疾病：对川崎病、过敏性紫癜、性早熟及矮小症等疾病有成熟的诊断治疗措施。