天津医科大学第二医院感染免疫科分为感染疾病科和风湿免疫科2个科室：
1、感染疾病科
床位编制数30张，是全国临床试验药理基地，现有感染性疾病研究所作为临床科研基地，参与各种抗菌药物临床研究。科室拥有医护人员31人，其中主任医师1人、副主任医师6人，硕士生导师1人，具有博士学位医师3人、硕士学位医师8人。自上世纪90年代开始针对各种感染性疾病、不明原因发热、自身免疫性疾病开展诊疗工作。
在诊治不明原因发热患者方面具有系统的临床诊疗思维。科室成立以来，更加专注于不明原因发热的诊疗和感染性疾病的诊治，指导全院抗菌药物的合理应用。
2、风湿免疫科
床位编制数12张，现有医生7人，其中主任医师2人、副主任医师3人，具有博士学位医师2人、硕士学位医师5人，在市级以上学术团体任职2人。
在多种结缔组织病如类风湿关节炎、脊柱关节病、骨关节炎，系统性红斑狼疮、干燥综合征，皮肌炎/多肌炎及血管炎等各种结缔组织病，及不明原因发热疾病、免疫功能损伤患者合并感染等内科疑难病诊疗方面具有丰富的临床经验。
目前风湿免疫科诊治的常见病种有：类风湿关节炎、强直性脊柱炎、银屑病关节炎、系统性红斑狼疮、混合性结缔组织病、干燥综合征、白塞病、大动脉炎、小血管炎、皮肌炎、成人Still病、结缔组织病相关肺动脉高压、IgG4相关疾病、风湿性多肌痛、痛风、骨质疏松、发热待查、自身免疫性肝病等。