驻马店市中心医院肛肠科组建于1991年，是市内综合性医院最早成立肛肠专科的单位。主要开展对结直肠肛周疾病外科手术治疗为主的综合治疗，业务范围包括结直肠肿瘤、骶前肿瘤、结直肠息肉、慢性便秘、肠梗阻、肠瘘、肛门和肛门周围疾病等。现有高级职称4名，研究生3名，共医护人员19人。均受过肛肠专科和肿瘤治疗、护理的严格训练。科室有专业床位45张，独立手术室两间，配有先进的电子结肠镜、腹腔镜、超声刀、乙状结肠镜、微波治疗仪、清创机等设备，每年收治住院结直肠肛门疾病手术患者近两千余例，门诊一万余人次。

在结直肠肿瘤方面，一直坚持肿瘤治疗的标准化、规范化和个体化原则；在肛周疾病方面，一直坚持无痛、微创、提高病人生活质量为准则。科室已开展各类结直肠肛门手术上万例，包括开展的大型及超大型手术有开放结直肠癌根治术及扩大根治术、超低位直肠癌保肛术、复发结直肠癌再手术、骶前巨大肿瘤切除术、便秘的综合治疗、一期肛门括约肌修复及会阴成形术等。

常规手术有：直肠黏膜环切术（PPH）、直肠前突修补术、直肠阴道瘘修补术、直肠脱垂悬吊术、痔疮、肛瘘、肛裂、肛周脓肿、会阴部坏死性筋膜炎等手术。较早开展直肠癌低位保肛术，距肛门4cm的直肠癌也能获得保肛。

在学术、科研方面，科室参加多个国内的随机、多中心治疗研究项目积极参加国内外、省内外的肿瘤、肛肠会议和学术活动。近年来在中华系列期刊及国家级期刊上发表论文近20余篇。