邓州市中心医院儿科下设呼吸哮喘变态反应专科、神经康复专科、儿童急危重症监护中心、内分泌专科、泌尿专科、消化内镜专科、血液免疫专科、心血管专科、中西医结合儿科等九大专科，均有资深专业技术人员为专科学术带头人。

科室有先进的专科评估设备：心脏彩超、多普勒B超、多系统螺旋CT、16导联多功能脑电图仪、神经行为发育评定训练等等，有完善的专科诊疗常规及全周的教授主任查房。

儿科分门诊、住院病区，日常医疗临床业务采用国际先进信息化系统支持处理。门诊实行24小时开诊制度，并没有夜间及周末节假日主任门诊（费用与平日相同），使患者得到优质全方位的首诊医疗服务。儿科运用危重病转运网络接受全省施行24小时出车转运病危病人，抢救成功率达95%以上。