郑州大学第三附属医院新生儿科是国家级新生儿保健特色专科、河南省临床医学重点学科、河南省新生儿重症救护网络中心、河南省危重新生儿救治中心、河南省新生儿重症专业医疗质量控制中心、河南省新生儿重症救护专业技术人员培训基地、国家级新生儿围产期医学专科医师规范化培训基地。
2018年被河南省卫健委评为“医疗质量控制先进集体”，2019年被河南日报社评为“影响河南特色品牌科室”，2020年成为中华护理学会新生儿专科护士京外临床教学基地。
科室诊治范围：
1.新生儿黄疸、溶血病、肺炎、败血症、窒息、脑损伤等常见病、多发病诊治；
2.早产儿、多胎儿、极低/超低出生体重儿及其并发症的综合诊治；
3.急危重症如多脏器功能衰竭、胎粪吸入综合症、气漏综合征、持续肺动脉高压、惊厥持续状态、休克、DIC、毛细血管渗漏综合征等；
4.复杂性双胎并发症、胎儿水肿/胸腹腔积液、严重出生缺陷、先天性遗传代谢性疾病的救治；
5.新生儿外科疾病的围术期管理。
新生儿科现有总面积3247㎡，分设足月儿病区（新生儿一科）、早产儿病区（新生儿二科）、新生儿重症监护科（NICU），设置床位150张，实际开放床位200张。
医护团队人才济济，梯队合理。现有医师40人，护士（师）119人，正副主任医师（教授）11人，其中博导3人、硕导8人、具有博士学位8人，科室医师全部具有硕士以上学位，并且多人具有国内外学习或工作经历。
科室积极承担着全省新生儿重症救护专业技术人员培训、危重新生儿救治中心建设指导、新生儿复苏培训、新生儿重症专业医疗质量控制等省卫健委部署的指令性任务。
在河南省卫生健康委的直接领导下，于1999年建立了河南省新生儿重症救护网络，拥有18家市级网络分中心，268家网络成员单位，形成辐射全省18地市的危重新生儿转运、救治体系，配备多辆具有转运呼吸机、转运暖箱等抢救监护设施的转运车，开展覆盖全省及周边省份的24小时全天候转运，并利用5G传输技术实现了实时会诊及多学科远程会诊。
2023被国家卫生健康委妇幼司评选为“中国儿童健康高质量发展优秀实践案例”。
新生儿科拥有河南省小儿脑损伤重点实验室、河南省儿科疾病临床研究中心、郑州大学先进医学研究中心三附院分中心等学术平台。在新生儿脑损伤的基础与临床研究方面处于国际领先水平。
学科与复旦大学附属儿科医院、重庆医科大学附属儿童医院、浙江大学医学院附属儿童医院、瑞典哥德堡大学围产医学中心、瑞典卡罗林斯卡大学医学院等多家国内外知名单位，建立有紧密的合作与交流关系。
科室设备精良，技术先进，配置有常频高频一体呼吸机、神经调节辅助通气（NAVA）呼吸机、神经重症监护单元、高级婴儿培养箱、早产儿眼底成像仪、亚低温治疗仪、一氧化氮吸入（NO）治疗仪等先进设备，积极开展新生儿早期基本保健、早产儿链式管理、序贯呼吸支持治疗、NAVA辅助通气、NO吸入、亚低温治疗、腹膜透析技术、同步换血技术；
功能磁共振成像联合振幅整合脑电图评估预后、早产儿发育支持护理、家庭参与式护理、中心静脉置管术、吞咽功能评估与干预、新生儿黄疸远程随访、5G新生儿重症监护智慧协同平台建设等先进救治和保健技术，危重新生儿尤其是早产儿的救治能力居国内先进水平。
在中国新生儿协作网全国100余家协作单位中，我院收治的胎龄<32周极早产儿/极低出生体重儿数量连续数年位居前列。近年成功救治胎龄24周、出生体重仅500G的超早产儿。
近年来承担国家级科研项目10余项，省厅级科研项目50余项，发表SCI论文60余篇，中文核心期刊论文200篇，获省部级及地厅级科研成果奖励8项，主编及参编专著18部，专利50余项，参与制定专家共识、指南及国际指南解读17项，每年举办国家级继续教育项目3～5期。