首都医科大学附属北京友谊医院北京热带医学研究所是我国成立最早的，也是我国北方地区唯一的热带医学研究所。创建于1978年，首任所长为中国科学院院士我国著名热带病专家、北京友谊医院首任院长钟惠澜教授，叶剑英元帅亲笔为研究所题名。
研究所主要开展热带病，特别是寄生虫病的临床与科研工作，多年来坚持科研、临床相结合的工作方法，建立了热带病形态学、免疫学及分子生物学检查体系，接诊来自北京、全国及世界热带病流行地区归国的热带病患者。该所是全国最早被WHO任命的世界卫生组织(WHO)合作中心，自1981年起曾先后任世界卫生组织利什曼病、肝吸虫病、肺吸虫病合作中心，目前为WHO囊虫病合作中心。
经过几十年的发展，研究所形成了一支拥有高素质人才的科研队伍，与世界卫生组织、热带病研究规划署等国际机构以及国家疾病预防控制中心、皮肤病研究所等合作在寄生虫病的诊断、治疗、防治策略等方面已开展了数十项研究项目和科研课题，并取得了一系列研究成果，李桓英教授曾获得国家科技进步一等奖，在国内外拥有极高的信誉和知名度。
北京作为我国的首都，随着与亚洲、非洲与拉丁美洲等热带病高发国家联系的日益紧密，北京热带医学研究所在建立符合国际水平的热带病诊断实验室、应用规范的检测技术建立快速、高效的热带病诊断技术平台等方面担负着重大的任务。