南宁市第二人民医院胃肠外科是广西医疗卫生重点学科、医院重点科室，国家级住院医师规范化培训基地及GCP基地。是广西医科大学硕士研究生培养点，科室有硕士研究生导师2人，博士2人，硕士11人。共有床位80张（包括西院区），年收治病人超3600余人，手术2500台。
主要诊疗的疾病包括：胃肠道良恶性肿瘤、急腹症、疝、腹腔感染、痔瘘等疾病。尤其擅长腹腔镜微创手术，1997年始开展腹腔镜微创手术，是广西最早开展此类技术的医院之一，手术创伤小、恢复快，疗效好。专科诊疗水平区内先进，特别是低位直肠癌保肛术、腹膜癌腹腔热灌注化疗、疝及痔瘘的微创治疗。
科室在国内外医学杂志发表论文一百多篇。承担区、市级课题10余项。科研项目获广西医药卫生适宜技术推广奖、南宁市科技进步奖、国家实用新型发明专利多项。科室立足国内现况，把握专业发展方向，全面提高临床诊疗水平，高效、安全地为广大患者解除病痛。