消化内科成立于1992年，目前已经发展成为以内镜微创治疗以及解决疑难危重病为特色，覆盖肝胆胰、胃肠等全病种的高水平、综合性学科，是中日友好医院疑难肝脏疾病诊治联合体成员单位，山西省消化内镜专科联盟副理事会长单位，运城市消化内科及消化内镜质控部挂靠单位，运城市医学会消化分会及消化内镜分会主任委员所在单位。2011年被评为运城市重点学科，2019年被评为运城市特色学科。科室由病房、门诊、内窥镜、实验室4部分组成，床位48张，设立肝病、胆胰、上消化道、肠病四个亚专业，内镜方面设有早癌、超声内镜、硬化、ERCP、胶囊内镜，ERAT、小肠镜7个亚专业。医疗人员共51人，医生26人，护士25人，其中主任医师5人，副主任医师8人，主治医师12人，硕士研究生学历18人；主任护师1人，副主任护师4人，主管护师17人，护理人员均为本科学历。科室在治疗肝病（各种急慢性肝炎，自身免疫性肝病、肝硬化、肝癌）、胆胰疾病（胆囊炎、胆结石、胆管结石、胰腺癌等）、食管、胃肠疾病（反流性食管炎、功能性胃肠病、消化性溃疡、消化道出血、消化道肿瘤，炎症性肠病）等方面有显著疗效，尤其是对疑难性肝病、炎症性肠病，消化道大出血、急性重症胰腺炎、肝硬化失代偿期等疑难危重病症的诊治成果显著。在内镜诊疗项目上可开展无痛胃肠镜，超声内镜、十二指肠镜、小肠镜、胶囊内镜等检查，治疗方面可开展逆行胰胆管造影（ERCP），胆胰管取石、支架植入术，食管胃底静脉曲张硬化套扎术、组织胶注射术，内镜下黏膜切除术（EMR）、内镜下黏膜剥离术（ESD）、内镜黏膜下肿瘤挖除术（ESE）、经口内镜下食管括约肌切开术（POME）、内镜下经黏膜下隧道肿物切除术（STER）、内痔硬化治疗术、轻症阑尾炎内镜下逆行冲洗术（ERAT）、超声内镜诊疗等技术。每年完成胃镜检查约12,000例，肠镜检查约7000例，胃、肠镜息肉治疗1300例，ERCP治疗近300例，硬化治疗约300例、ESD约200例、小肠镜检查约10余例，为运城市之最。现有多项科研项目正在进行，如药物临床项目的“清肠温中片治疗中度活动性溃疡性结肠炎”，“片仔癀治疗慢性乙肝”，“胃复春胶囊治疗慢性萎缩性胃炎”等，每年均有数量不等的学术论文在不同级别的刊物上发表。目前科室与北京、上海、西安等多家医院教授团队建立协作关系，确立医疗技术帮扶，具有较高的诊治水平及服务能力，在晋南的影响力不可替代。