山西医科大学第二医院感染性疾病科，成立于2004年，于2019年成立住院部病房。收治细菌、真菌（特别是耐药菌）所致的全身各器官系统“非传染性”感染性疾病，是山西省唯一一家与欧美先进国家感染科接轨的符合现代感染病学发展方向的感染性疾病科。
随着我国经济社会和医学科学的发展以及人口老龄化社会的到来，我国感染性疾病的构成发生了重大变化。一方面大量经典传染病销声匿迹，另一方面，非传染性感染性疾病（特别是危重病人的院内感染、耐药菌感染）逐年增多，耐药菌感染形式严峻，成为临床感染病学面临的新的重大课题，也是严重影响人民群众生命健康的重大问题。
上述情况类似于二十世纪60年代欧美国家的状况（经典传染病几乎绝迹，耐药问题和院感等新问题开始显现），鉴于以上原因，欧美国家感染科成功转型为“非传染性感染疾病治疗、院内感染管理、临床微生物结果解读、抗菌药物管理”的大感染科模式，为我国感染性疾病科的转型和发展提供了借鉴和方向。
山西医科大学第二医院感染性疾病科准确把握学科发展脉搏，顺应学科发展潮流，建成了我省唯一一家以大感染科模式运行的感染性疾病科。
感染性疾病科开放床位共36张，现有医师9名，其中主任医师3名，主治医师5名，住院医师1名；硕士生导师2名，硕士学历人员6名。
专注于诊断治疗细菌、真菌（包括耐药菌）所致的全身各器官系统感染性疾病。具体细分为以下几方面：
（1）不明原因发热；
（2）疑难危重症细菌、真菌感染；
（3）耐药菌感染；
（4）免疫功能低下患者的感染：肿瘤放、化疗后感染，器官移植后感染，糖尿病患者感染，多器官功能障碍感染，接受免疫抑制剂治疗患者感染；
（5）术前、术后感染；
（6）院内感染防控；
（7）抗生素合理使用；
（8）临床微生物结果解读等。