首都儿科研究所附属儿童医院中医科，1984年由张梓荆、马云龙建立，是我院较早建立的临床科室之一。

2017年7月1日，我院与北京中医医院成立中医儿科医联体。

2018年于我院中医科建立北京市中医局薪火“3+3”工程温振英名老中医工作室分站。

目前中医科现有医师14名，其中主任医师3名、副主任医师2名，主治医师6名，住院医师3名，护士2名。其中博士生2名，硕士生7名，中级护师2名。现有诊室3间、治疗室1间，包含门诊诊位4个、治疗诊位3个。