首都儿科研究所附属儿童医院内科，以常见病、多发病为主，并开设了神经专业、呼吸专业、内分泌专业、肾脏专业、血液专业、心血管专业、新生儿专业、消化专业门诊，尤其在诊治小儿咳嗽、小儿发烧、小儿呕吐、小儿发热、小儿哮喘、儿童咳嗽、婴儿便秘等方面具有显著的优势。

现有的专家门诊、专业门诊均由副主任医师以上职称人员出诊，普通门诊出诊的医师也均是有3年以上临床经验的主治医和高年住院医担任。

全年就诊人数约在40万～50万人次。

首都儿科研究所内科为了方便患儿就医，内科门诊全年无假日，每天早8点至晚10点开诊。