首都儿科研究所附属儿童医院普外科（普通(新生儿)外科），为国家重点专科，是国家“十一五”科技支撑计划课题和国家卫计委卫生行业专项课题先天重大畸形治疗技术科技攻关牵头单位，全国小儿微创外科治疗中心和疑难危重患儿治疗中心，承担北京大学医学部，北京协和医学院和首都儿科研究所的教学工作及研究生培养工作，北京市住院医师规范化培训基地。1986年成立，医生33人，护士72名，包括主任医师7人，副主任医师6人，主治医师6名，住院医师14名。学历构成：博士11名，硕士13名。博士生导师3名，硕士生导师1名。腔镜微创手术（腹腔镜、胸腔镜项目），内镜治疗技术（胃肠镜、胆道镜、ERCP等），危重及疑难患儿转运（本院救护车转运）和绿色通道（急诊直接入院），新生儿和儿童外科重症监护生命支持（无创呼吸机、有创常频呼吸机、有创高频呼吸机），静脉中心置管（PICC、CVC、输液港）。