厦门大学附属中山医院血液科是闽南地区规模最大的血液病治疗单位，是厦门市重点专科，福建省造血干细胞移植基地之一，中华骨髓库非血缘移植成员单位，中国脐带血库移植成员单位，是厦门大学、福建医科大学内科血液学硕士和博士培养单位。

科室设置专科病床48张，层流病床9张，设有单独移植病区，以各类白血病、淋巴瘤、骨髓瘤以及各类贫血、出血性疾病为主要诊疗对象。科室以造血干细胞移植治疗白血病，恶性淋巴瘤、骨髓瘤为主要特色。

在非亲缘干细胞移植、单倍体干细胞移植、脐带血干细胞移植、CD34纯化的干细胞移植等领域达到国内先进水平，在造血干细胞移植治疗免疫性疾病和儿童地中海贫血方面经验丰富，达到国际先进水平。

科室重点开展急性白血病、多发性骨髓瘤的分子诊断和靶向治疗研究，主持多项国家自然科学基金和省市科技项目，三次获得厦门市科技进步奖。科室成员均具有硕士或博士学位，主要技术骨干具有国外学习经历，能为患者提供优质、高校的医疗技术服务。