厦门大学附属中山医院小儿外科是一个综合治疗小儿（18岁以下）外科疾病的专业，集临床、教学、科研于一体。技术力量雄厚，医疗整体技术已达到国内先进水平；人才梯队完整，现有医护人员30余人，其中高级职称2人、中级职称2人、博士1人、硕士3人。目前诊疗范围包括：小儿急腹症、急性感染、畸形、肿瘤等外科常见病及疑难重症疾病；现已常规开展包括阑尾炎、肠套叠、各种肠梗阻、美克尔憩室、消化道重复畸形、先天性巨结肠、乙状结肠冗长症、先天性胆总管囊肿、甲状腺疾病、先天性肛门直肠畸形、后天性肛门直肠疾患、门脉高压、消化道出血、消化道畸形、大网膜囊肿等腹部肿物。以及膈疝、腹壁疝（脐膨出）、腹股沟斜疝、血管瘤（淋巴管瘤）、小儿畸胎瘤、腹膜后肿瘤、尿道下裂、包茎、鞘膜积液、隐睾等病种在内的各种手术诊疗科目，并开展腹腔镜辅助下微创手术。