厦门大学附属中山医院消化内科是首批国家临床重点专科、福建省临床重点专科、福建省肠道微生态与消化系统疾病防治临床医学研究中心、厦门市医学领先学科、厦门市拔尖重点专科，也是厦门大学医学院消化病学系、厦门大学消化疾病研究所、厦门市消化疾病诊治中心挂靠学科，作为中华医学会消化内镜培训中心厦门培训基地、中国ERCP技术标准化人才培养项目培训基地、中国医师协会消化内镜医师培训基地、中国消化内镜中心认证示范单位、中国炎症性肠病(IBD)区域诊疗中心、“幽门螺杆菌规范化诊治门诊”全国级示范中心、海峡两岸医药卫生交流协会消化内镜培训基地、海峡两岸消化疑难病会诊基地、海峡两岸消化系肿瘤早期诊断和治疗基地、厦门市消化内科专业质控中心、厦门市慢性胃肠病分级诊疗专病防治中心、海峡两岸医药卫生交流协会消化病学分会挂靠单位、厦门市李兆申院士名医工作室挂靠单位，拥有厦门市肠道微生态与健康重点实验室、厦门大学医学院微生态研究院和国家临床医学研究中心（西京、长海、友谊）核心协作中心等平台。本专业集医、教、研为一体，技术力量雄厚，现有医护人员150余人，其中国家卫生健康突出贡献中青年专家1人、国务院特殊津贴专家1人、闽江学者特聘教授1人、博士研究生/博士后导师2人，硕士研究生导师9人，主任医师、教授13人，副主任医师、副教授10人，主治医师13人，住院医师7人，医师中拥有博士学位28人，硕士学位12人，其中多人有海外留学经历。拥有各种先进的诊疗及科研设备，同时设有消化名医门诊、特需门诊、专家门诊、专病门诊、消化内镜中心、肠菌移植中心和消化实验室。目前，病区开放床位为120张，年门诊量17万余次，年出院6000余人次，年内镜诊疗6万余人次。消化内科坚持以临床为核心，教学、科研为动力，目前本学科已成为海西地区消化病和消化内镜专业的领军学科。