福建医科大学附属第二医院胃肠食管外科，科室以微创为理念，以规范化治疗为基础，拥有雄厚的技术力量和充满朝气的队伍，在国内有较大影响。目前科室设有1个病区，共45张床位，实收住院病人70人以上。拥有高级职称者5名，其中教授3名、博士生导师2名、硕士研究生导师3名；中级职称者3名，博士、硕士学位者占医师总数的95%以上。科室主要致力于胃肠道肿瘤的外科诊治及基础临床研究，每年完成600余台胃肠道肿瘤规范化手术，其中完全腹腔镜下胃癌根治术+脾门淋巴结清扫、保留盆腔植物神经的全直肠系膜切除、直肠癌超低位切除吻合术。直肠癌侧方淋巴结清扫等术式处于国内领先水平。特别是针对低位直肠癌开展的三保留直肠癌根治术（保留排便功能、排尿功能及性功能），极大地提高了患者的生活质量。现任福建医科大学附属第二医院院长许建华教授，作为学科带头人，具有三十余年胃肠道恶性肿瘤临床工作经验，主要的研究方向为胃肠道恶性肿瘤的临床早期诊断、治疗及其病因学的分子生物学基础研究。在熟练传统开腹手术的基础上，娴熟地掌握了腹腔镜胃肠微创手术这一新技术，并将之发展为胃肠外科的特色诊疗项目，为广大患者提供微创治疗的平台，大大减轻了患者的痛苦。科室已在国内外医学期刊中公开发表论文50多篇，其中SCI论文20余篇；并于2013至今连续主办了8届国家级学习班—“海峡西岸胃肠肿瘤微创外科论坛”，多次受邀在全国性会议上现场行“腹腔镜下胃肠肿瘤微创手术”演示及专题报告，受到国内外同行广泛赞誉。科室获得省“五一先锋号”称号、医院“十佳医疗团队”，是中华结直肠MDT联盟成员单位、福建省ERAS外科示范病房，泉州市医学会加速康复学会、泉州市抗癌协会、泉州市腔镜质控中心挂靠单位。