赣州市第五人民医院肝胆胰外科(普外科)是赣南地区集技术创新、复杂疑难病诊治最富影响力的肝胆胰疾病治疗中心之一，是南昌大学第二附属医院肝胆胰外科“邹书兵专家团队”合作科室，并与福建医科大学孟超肝胆医院建立长期技术帮扶。诊疗技术步入国内先进、省内领先水平，2021年腹腔镜肝右后叶手术视频被博鳌外科收录，2022年肝恶性肿瘤手术全省排名第6。常规开展胃肠、甲状腺、乳腺、疝、肛肠等普外常见疾病的微创手术和各类肝胆胰疾病及普通外科手术、微创及介入手术，尤其是腹腔镜下精准肝切除、解剖性肝切除、腹腔镜胰十二指肠切除术、腹腔镜下胆肠吻合术、腹腔镜巨脾切除等一系列高精尖手术。现有医务人员22人(其中，高级职称4人)，开放床位79张。专科特色肝恶性肿瘤切除(腹腔镜肝切除)已成熟开展了腹腔镜下肝癌根治性切除，包括腹腔镜下左半肝、右半肝、右前叶、右后叶、左外叶、尾状叶等规则肝切除，腹腔镜下肝段、肝叶解剖性肝切除。肝硬化门静脉高压症微创治疗(腹腔镜脾切除)市域内最早及成熟开展门静脉高压脾亢及合并肝癌的微创治疗-腹腔镜下巨脾切除、断流手术、腹腔镜肝脾联合切除；开展例数全省位居全省前列。梗阻性黄疸的外科治疗胰腺，壶腹部，胆管肿瘤手术：腹腔镜下胰十二指肠切除，常规胰十二指肠切除等，肝门部胆管癌根治术；胆石症的ERAS快速康复-腹腔镜下胆囊切除、腹腔镜下胆总管切开取石术等。腹腔镜微创手术包括腹腔镜结肠癌根治术、直肠癌根治、低位保肛术；腹腔镜胃癌根治术、腹腔镜阑尾切除术；腹腔镜胃肠穿孔修补术；腹腔镜下成人疝修补等。