合肥市第二人民医院儿科科室目前有编制床位60张。拥有主任医师1人，副主任医师5人，主治医师5人，住院医师8人，其中博士1人，硕士5人，目前拥有多个亚专业组。新生儿专业：为合肥市危重新生儿救治中心，编制床位18张，拥有副主任医师1名，高频呼吸机1台，常频呼吸机1台，无创呼吸机4台，“长颈鹿”暖箱2台，其他暖箱10余台，已开展呼吸机支持治疗、动静脉同步换血、PICC静脉营养等技术。儿童呼吸专业：中国科学技术大学附属第一院（安徽省立医院）“儿科哮喘与结核病专科联盟”单位，获批“儿童哮喘标准化门诊”，拥有副主任医师1名，除常规开展支气管炎、肺炎、支气管哮喘等呼吸道常见病、多发病诊治外，已开展支气管镜肺泡灌洗、异物取出等相关技术，常规开展肺功能检查。儿童消化专业：拥有副主任医师1名，常规开展腹泻病、急慢性胃炎、消化性溃疡、婴儿胆汁淤积症、急性胰腺炎、脱水补液等治疗，拟开展儿童消化内镜诊疗技术。儿童血液专业：拥有博士/副主任医师1名，常规开展骨髓细胞学、免疫学、遗传学及分子生物学等检查，开展急性白血病、溶血性贫血、营养性贫血、免疫性血小板减少症、血友病等疾病的诊治，已诊断新生儿白血病1例（急性非淋巴细胞白血病，M5），诊治新生儿G-6-PD缺乏症1例。儿童内分泌专业：拥有主任医师1名，常规开展生长激素缺乏症（矮身材）、性早熟、儿童糖尿病、先天性甲状腺功能减退症等疾病诊治。儿童重症专业：拥有副主任医师1名，常规开展重症肺炎、重症哮喘、重度脱水、急性中毒等疾病诊治。同时开展儿童神经、泌尿、心血管系统常见病及感染性疾病的诊治。科室科研氛围浓厚，主持课题多项，发表学术论文多篇，其中SCI收录论文1篇，获得实用新型专利1项，并承担安徽医科大学、蚌埠医学院、皖南医学院的本科教学工作及全科医师的住培工作。儿科全体医护人员愿以精湛的技术、热情的服务为本地区及周边县市儿童健康保驾护航。