合肥市第二人民医院普外科是合肥市第七周期临床重点培育专科，蚌埠医学院，皖南医学院硕士研究生培养点、国家住院医师规范化培训基地。学科现有四个病区，开放床位179张，现有专科医师40人，其中主任医师2名，副主任医生27名，博士2名，硕士29名，硕士生导师9人。近年来，获批省、市及高校级科研项目共17项，其中合肥市应用科技课题1项，院级科研课题13项，发表论文24篇，其中SCI期刊论文10篇，发明专利8项。学科设有胃肠外科，肝胆胰外科，甲乳、肛肠外科四个亚专科病区。常规开展的特色技术有腹腔镜胃肠癌根治术、进展期结、直肠癌的MDT个体化治疗、各种复杂肝内外胆管结石的微创治疗、其中ERCP（内镜下逆行性胰胆管造影）、PTCS（经皮经肝胆道镜取石术）技术、肝胆胰良恶性疾病的腹腔镜及开放手术治疗、肝癌微波射频消融；腹壁疝修补术；腹腔镜下腹股沟疝修补术(LIHR)；甲状腺良性结节的微波消融治疗、不同手术路径（经胸乳入路、经腋窝入路、经锁骨下入路、经口腔前庭入路、经颏下入路）的腔镜下甲状腺手术、乳腺良恶性肿瘤的综合治疗、肛肠疾病的微创治疗等。近年来，陆续开展了代表外科发展水平的达芬奇机器人支持下的胃结直肠癌根治术、肝胆胰良恶性肿瘤的手术治疗。