合肥市第二人民医院呼吸内科（呼吸与危重症医学科）是合肥市第七周期临床重点培育专科，安徽医科大学、蚌埠医学院、皖南医学院、安徽理工大学硕士研究生培养点，慢阻肺通科临床药师培养单位，国家住院医师规范化培训基地，国家（PCCM科）介入呼吸病学、呼吸康复进修基地，国家呼吸临床研究中心-中日医院呼吸专科医联体及慢阻肺协作组成员单位。学科开放床位182张，拥有四个病区及RICU病房。学科分设感染、呼吸慢病与康复、呼吸危重症、胸部肿瘤与介入呼吸病学四个独立病区的亚专科，开设肺癌与肺结节、呼吸睡眠、慢阻肺、戒烟、间质性肺病、支气管哮喘等专病门诊。设有呼吸内镜与介入诊疗中心、肺功能室、睡眠监护室、呼吸治疗室、呼吸康复病房等。学科现有高级职称12人，教授、副教授7人，研究生导师5人，博士（含在读）7人。近年来，发表SCI论文14篇，最高影响因子7.4分，中华及北大核心论文4篇，主持和参与各级各类科研项目30余项。常规开展的特色技术有俯卧位通气技术，有创、无创机械通气技术，呼吸力学监测技术、血流动力学监测技术、床旁血液净化技术、重症康复技术在重症患者中的应用；复杂感染的病原微生物的基因测序联合传统病原学技术；呼吸慢病康复技术；经支气管镜取异物、气管支气管肿瘤的电凝消融、冷冻等治疗技术；气管支气管狭窄的球囊扩张、气道支架置入技术；超声支气管镜检查+快速评价技术（EBUS+ROSE）、内科胸腔镜检查及治疗技术；影像学引导下经皮肺组织穿刺活检术、经皮肺部肿瘤热消融术；肺栓塞规范化诊疗等。