绍兴第二医院消化内科，创立于1983年，系省消化学科联盟单位。设有消化内科病房、内镜中心、炎症性肠病治疗中心、胃肠动力检测实验室、小肠胶囊内镜检查诊断中心等，集临床、教育、科研、预防于一体。

科室现有核定床位48张，医护人员28名，其中主任医师5名，副主任医师4名，副主任护师1名，研究生6名。

科室已建立较完善的诊治体系，形成以消化系统常见病、内镜下检查治疗和炎症性肠病为特色的诊疗体系。开设食道、胃肠、肝胆胰消化系统疾病及炎症性肠病等特色专科门诊，尤其在内镜下检查和治疗、炎症性肠病诊治方面积累丰富的临床经验。开展胃肠道内镜下息肉摘除术、内镜下粘膜切除术（EMR）、内镜下粘膜下剥离术（ESD）、食管静脉曲张硬化疗法、超声内镜检查、胶囊内镜检查、急诊内窥镜检查、逆行胰胆管造影、食管粘膜染色、内镜下止血术、上消化道异物取出术、胃肠动力检测等。

拥有Olympus电子内窥镜系统（包括电子胃镜、电子十二指肠镜和电子结肠镜、超声内镜及相应的诊疗配件）、以色列GIVEN胶囊内镜、碳14碳13呼气试验仪等。

科室注重学科建设和科技创新，在食道、胃肠、肝胆胰消化系统疾病及炎症性肠病等的基础和临床研究方面有较深入的、创新性研究。定期选派科室成员到上级医院进修学习，每年举办市级继教3-4项，承担了省、市级科研课题，在国内一、二级杂志发表多篇学术论文。科室是进修实习基地，并承担国际文化交流的任务。

科室与浙大一院、浙大邵逸夫医院等对口科室建立合作关系，有浙大一院消化内科专家、浙大邵逸夫医院炎症性肠病专家定期来院坐诊。