台州市中心医院普外科成立于2000年，是全国微创重点学科上海瑞金医院微创外科临床研究中心台州分中心，台州市重点扶持学科，是我院首批重点学科，浙江省“巾帼文明岗”，是浙江省首批住院医师规范化培训基地，浙江大学微创研究所，加速康复外科示范分中心，台州市腔镜示范中心，拥有台州市普外科重点实验室。
本科室以肝胆胰脾外科、血管外科及腹壁与疝外科为主要特色，尤其在腹腔镜微创外科方面，腹腔镜肝切除、腹腔镜胰腺手术、腹腔镜脾切除、腹腔镜疝修补、单孔腹腔镜技术、腔镜结直肠肿瘤根治术等多项技术在台州率先开展，填补多项台州市空白，处省内先进水平。
本科室共有医生11名，护士16名，其中有硕士生导师1名，教授2名，主任医师2名、副主任医师3名，主治医师1名，副主任护师2名。科室拥有台州市专业技术拔尖人才1人，台州市名医1名，台州市重点学科带头人1名，台州市后备学科带头人2人，浙江省“151”人才1名、台州市“211”人才2名，建有台州市名医工作室1个，医学硕士9名。
病区床位数43张，年收治患者2300余人次，手术量1500余台次。
2000年6月，胃肠肛肠外科隶属于大外科，2001年，成立普外科，2003年，普外科专科细化，肛肠外科独立建科，2013年，设独立病区，同年评为我院重点学科，2017年，更名为胃肠肛肠外科，2019年，医院开展专科专治，专收治胃肠、肛肠及疝疾病。学科分胃肠、肛肠、疝外科三个医疗组，床位54张。
现有医护人员28人，其中主任医师3人，副主任医师3人，医师6人；护士18人，主管护师7人。2001年，学科成为我院重点学科；2005年，成为台州市重点扶持学科；2016年，成为台州市医学重点支持学科；2019年，成为医院重中之重学科。
2000年6月开诊以来，学科主要收治胃肠、肛肠、肝胆、腹壁疝及腹部创伤性疾病患者，门诊人次18余万，收治病人3万余人次，其中手术2万余人次。
2019年，医院开展专科专治，主要收治胃肠、肛肠及疝疾病，全面开展腹腔镜微创外科手术，并逐渐形成以胃肠道良恶性肿瘤规范、精准化综合治疗，胃肠道微创手术，常见肛肠疾病及腹壁疝个体化治疗为特色的学科。