杭州市中医院针灸康复科（针灸科）成立于1952年，是杭州市中医院最早建有的科室之一，2016年科室规模壮大，更名为针灸康复科，2018年科室与针推康复分中心合并，并进入两院区大发展时代，目前是国家中医药管理局“十二五”重点专科，浙江省中医药管理局“十一五”重点专科，杭州市医学重点学科（一类2017-2019），杭州市医学重点学科（2020-2024），杭州市中医康复质控中心（牵头单位），国家针灸临床医学研究中心协作单位，长三角区及华东区中医针灸诊疗中心联盟合作单位，浙江省康复专科联盟单位，长三角中西医结合心肺康复联盟创始成员单位，浙大一院康复医学专科联盟单位。本科室中医特色鲜明，秉持“针灸康复为特色，中西医康复相结合”的原则，以临床为主，教学、科研并进。2021年成立齐永脐针工作室。现拥有武林、丁桥两个病区，开放总床位数89张，年出院近1千余人次。针灸康复科还设立颈肩痛、腰腿痛、面瘫、产后康复、颞下颌关节康复专科门诊，全科年门诊6万余人次。本科室奠基人是已故著名针灸医家马石铭先生。科室现有77名成员，医生32名，主任中医师7名，副主任医师9名，拥有市级名中医1名，全国中医临床优秀人才1名，浙江省青年名中医培养对象1名，浙江省中医护理优才培养对象2名，硕导3名，博士7名，硕士23名，中医专业技术人员81.25%，硕士生比率71.8%；博士生比率21.8%。本科室充分发挥针灸康复特色优势，坚持中西医康复并重，重点围绕中医康复形成了四大临床特色方向，分别是：1、脑功能障碍疾病的针灸康复治疗（中风后偏瘫、失语、吞咽障碍、平衡失调、二便障碍、睡眠障碍、认知障碍等）。2、面神经疾病的针灸康复治疗（急性期、恢复期、难治性面瘫）。3、骨关节疾病的针灸康复治疗（颈椎病、落枕、腰椎间盘突出、慢性腰痛、肩袖损伤、肩周炎、肩关节不稳、急性踝扭伤、习惯性踝扭伤、前交叉损伤、内外侧副韧带损伤、半月板损伤、膝骨关节炎、脊柱侧弯、颞下颌关节紊乱、骨科术后康复）。4、孕产疾病的针灸康复治疗（产后腰痛，耻骨联合痛，腹直肌分离，尿失禁，慢性盆腔疼痛，产后子宫复旧不良等）。承担省部、厅局级科研项目50余项。获浙江省科技进步奖、浙江省中医药科技创新奖、杭州市科技进步奖等10余项奖励，累计发表专业论文数百篇，SCI6篇，出版专著6本。接收进修医师及外国留学生数百余人次，规培医生500余人，培养研究生40余人。2017年荣获杭州市巾帼文明岗称号，2022年荣获浙江省巾帼文明岗。