浙江大学医学院附属第一医院消化内科分为消化内科（一）和消化内科（二）两个科室。

消化内科（一）

浙江大学医学院附属第一医院消化内科是浙江省专业学科最早建立且规模最大的科室，是国家临床重点专科、国家消化内镜诊疗技术培训基地、浙江省医学重点学科、浙江省消化系疾病研究领域牵头单位之一，集临床、科研、教学为一体，近年来学科建设迅猛发展，２０２１年成为浙江省消化系统疾病临床医学研究中心，科室逐渐成为国内一流的国际性、开放式、综合性的消化病学科和消化病实验基地，消化病学在２０１９年度、２０２０年度、２０２１年度连续三年中国医院科技量值（ＳＴＥＭ）排名全国第一。

消化内科目前设有门诊、病房、消化内镜中心、胃肠动力室和消化实验室，分布于我院四大院区。

消化内科（二）

浙江大学医学院附属第一医院消化内科是国家临床重点专科、浙江省医学重点学科，国家级消化专科医师和消化内镜医师培训基地和博士后流动站。消化内科（二）于２００２年独立建科，现有固定床位共计５７张（庆春院区３５张，之江院区２２张），设有消化内科门诊、消化内镜中心，是浙江省唯一的消化内镜创新学科。