惠州市第三人民医院神经内科是惠州市临床重点专科，广东医学院硕士研究生培养单位。拥有一支高素质的技术骨干队伍，其中主任医师4人、副主任医师6人；教授1人，副教授5人、博士2人、硕士18人。目前开放床位106张。二期投入使用后，开放床位达144张。年均收治患者约2500人次、专科门诊诊疗人数约3万人次。
科室常年开展脑电图、动态脑电图、24小时长程视频脑电图、经颅多普勒超声、肌电图、诱发电位、脑血流超声检测等检查项目。医院拥有1.5T核磁共振、128排宝石能谱螺旋CT、64排螺旋CT、DSA、彩超等大型诊疗设备，能有效地满足临床医疗的需要，保证高质量的专科治疗护理水平。
神经内科一区：为脑血管专区，主要收治急性脑血管病患者，目前重点开展的诊疗项目有：
1.开展急性脑梗死rt-PA静脉溶栓治疗，开通了卒中救治绿色通道，能对院前、院中的卒中患者实行快速救治；
2.缺血性脑血管病的神经介入治疗，包括全脑血管造影术，颅内外血管狭窄的支架植入术等；
3.成立了脑卒中健教中心和预警诊治中心，能按照国家单病种质量管理要求对所有脑卒中患者实行规范化的诊断、治疗、康复、预防和健康教育，对卒中高危患者进行卒中预警；
4.依托神经电生理中心的建设要求，强化神经电生理诊疗技术，开展卒中TCD微栓子监测；
5.成立神经康复中心，对脑卒中患者能早期开展包括语言、吞咽、肢体、心理等的神经康复治疗；
6.与医院健康管理中心合作开展卒中早期筛查；
7.成立卒中单元，并成为“中国卒中中心联盟”医院，为规范卒中诊疗，不断改进医疗质量提供技术保障。
神经内科二区：重点开展脑血管病、癫痫、神经变性、感染、免疫等疾病的诊治，突出了专科特色。
1.脑血管病：重点开展急性脑血管病的内科保守治疗及脑血管病的一二级预防；采用脂蛋白相关磷脂酶A2等手段筛查脑血管病高危人群等；
2.神经变性病：包括帕金森病、进行性核上性麻痹等运动障碍疾病等神经系统退行性病变的临床诊断和治疗；
3.神经感染与免疫：各种脑炎、脑膜炎、脑寄生虫病、脑脓肿、脊髓炎、多发性硬化及其他炎性脱髓鞘疾病、重症肌无力、系统性自身免疫病所致的中枢神经系统损害等；
4.癫痫：能对癫痫患者进行系统的诊断和治疗，对癫痫患者进行全程管理；
5.周围神经疾病的诊治：吉兰巴雷综合征、末梢神经炎、神经病理性疼痛等；
6.强化神经电生理检查技术，开展24小时视频脑电图；
7.开展帕金森病诊治新技术—DBS，与神经医学中心内外科联合开展脑深部电刺激术，2017年开展粤东地区第一例“帕金森病脑深部电刺激术（DBS）”；
8.与检验中心合作，开展病理、免疫、基因诊断和染色体核型分析等项目；
9.与神经医学中心康复病区合作，进行神经康复治疗；
10.应用A型肉毒毒素治疗局限性肌张力障碍；
11.开展特色专科门诊：①头痛头晕门诊、②帕金森病门诊③癫痫门诊等。
神经内科三区：诊治神经系统常见病、多发病。以对睡眠障碍、焦虑抑郁状态、记忆认知障碍等疾病的进行筛查、评估、干预为特色的亚专科。
1.应用多导睡眠监测仪、心理测评软件系统、影像学等手段全面评估，为睡眠障碍患者提供“筛查、评估、诊断、干预、预防”五位一体的诊疗模式；
2.睡眠障碍、焦虑抑郁状态：根据评估结果，采用个体化诊疗方式，结合药物-心理干预（CBT-I）-物理治疗（经颅磁刺激、微电流刺激）-替代医学（MBT-I等）等多种手段，进行综合干预治疗；
3.认知障碍：针对主观认知障碍、轻度认知障碍、阿尔茨海默病、血管性痴呆等认知障碍，采用国际上通用的ATN（以检测Aβ淀粉样蛋白+Tau蛋白+Neuron神经元受损为主）诊断阿尔茨海默病的模式，综合神经心理量表评估、脑脊液（Aβ42、Aβ42/Aβ40、P-tau181等）、神经影像学等手段，对患者进行全面筛查、评估、诊断，根据具体病情，进行药物-物理治疗-心理干预-替代治疗等治疗手段进行个体化治疗；
4.开设特色专科门诊：记忆门诊、睡眠门诊、心理门诊。