徐州市中医院中医外科是江苏省重点专科，科室设有专科专病门诊五个，病区2个，开放床位70张，根据各医疗组专业特长不同，强化中医药特色技术应用，提高疗效，针对中医外科优势病种开设专病或专科门诊，分为甲状腺乳腺外科、肝胆胰外科、胃肠外科、疮疡外科、微创外科。目前科室形成以中青年骨干为主的专科队伍。并设有中医综合治疗室，临床研究室、临床教研室、专科换药室等，拥有主任中医师1人，副主任中医师4人，硕士研究生2人，科室承担江苏省中医药管理局及徐州市卫生局等多项课题研究，专科业务量和医疗能力达到较高水平。科室在中医药治疗乳腺疾病、中医特色治疗疮疡病，以及中西医结合治疗恶性肿瘤和周围血管病等方面优势突出，形成了稳定的研究方向和临床特色医疗。优势病种有乳痈（急性乳腺炎、浆细胞性乳腺炎），丹毒(急性淋巴管炎)，肠结（急性单纯性肠梗阻），脱疽（肢体闭塞性动脉硬化）。在治疗疮疡方面，灵活运用生肌散、生肌膏和九一丹等药物，根据溃疡不同阶段，深度和大小，辨证施治，疗效满意。自行研制通脉汤下肢动脉硬化闭塞症，抗癌Ⅰ号治疗结直肠癌、乳腺癌、胃癌，丹毒清毒汤减少丹毒复发等，效果良好。在治疗下肢血栓性浅静脉炎方面，急性期采取中西医结合短期联合用药，早期手术，缩短住院时间，提高临床疗效显著。科室开展了中药灌肠治疗溃疡性结肠炎、肠梗阻等疾患；耳穴治疗呕吐、以及术后镇痛等；灸法联合针刺技术促进胃肠动力恢复；中药（九一丹、八二丹、五五丹）药捻治疗窦道；手法按摩治疗乳腺增生、乳腺炎、外伤后遗症等；祛腐生肌中药伤口换药治疗伤口不愈合、慢性溃疡；蜈蚣蛋治疗淋巴结结核等特色疗法，广泛运用于临床。科室积极研发院内制剂，已研制使用了生肌散、生肌膏、金黄散、青黛散、青蛤散、九一丹、活血消肿膏等外用药制剂以及消痛散结片、通脉合剂、抗癌Ⅰ号等多种口服制剂。学科带头人有吴建华主任中医师、鞠振国副主任中医师、尹斌文副主任中医师，吴建华主任任江苏省中西医结合乳腺外科常务委员，徐州医学会肿瘤委员会委员，在淮海地区享有较高的知名度和声誉。