常熟市中医院肛肠病科，国家中医药管理局“十二五”中医重点专科。肛肠病科是国家中医药管理局“十二五”中医重点专科、全国农村中医特色专科建设单位、第二批全国农村医疗机构中医特色专科、苏州市重点中医临床专科、常熟市临床重点专科。肛肠病科成为苏州市具有广泛影响力的肛肠病特色专科。近年来，肛肠病科承担着江苏省中医药管理局、苏州市及常熟市科技课题，先后获得省、市级科技进步奖、医疗新技术引进奖。肛肠病科重点对排便障碍性疾病和炎症性肠病，从中医基础理论考量，并传承创新，成为肛肠病科优势病种。