南京市中西医结合医院针灸科经三十年临床积累逐渐形成独特的治疗风格，采用针灸、拔罐、牵引、推拿、耳穴贴压、中药熏蒸、微波、超短波理疗等多种方法治疗多重常见疾病。如中风偏瘫、慢性胃肠疾患、“冬病夏治”治疗慢性支气管炎、哮喘、面瘫、呃逆、失眠、各类肌肉劳损、急性扭伤、腱鞘炎、网球肘、颈椎病、肩周炎、腰椎间盘突出症、风湿、类风湿性关节炎、骨折后恢复期的康复治疗、各种骨与关节退形性病变、痛经、慢性盆腔炎、月经不调、产后尿潴留、小儿肌性斜颈、小儿各类腹泻及胃肠功能紊乱、小儿脑瘫、神经性皮炎、皮肤瘙痒症、带状疱疹、慢性鼻炎、慢性咽炎、假性近视、耳鸣、眩晕等。此外依据中医脏腑经络理论，开展针灸治疗单纯性肥胖症。