南京市儿童医院心血管内科，创建于上世纪70年代，是国内最早一批成立的小儿心血管专科，是国内知名的小儿心血管疾病诊疗中心、江苏省先天性心脏病诊疗中心。常规开展的专科技术主要包括：先天性心脏病的介入治疗（累计完成6000余例)；儿童心脏起搏电生理及射频消融治疗；在国内较早开展儿童罕见代谢性心肌病的遗传诊断和精准诊治；开展川崎病合并冠脉病变的规范化管理和冠状动脉造影术；各种心脏功能性检查评估。

2019年在省内首次、国内首批开展儿童心脏左束支起搏技术，获省卫健委医学新技术引进奖二等奖；2021年起在省内首次开展儿童房间隔缺损和室间隔缺损的经皮可吸收材料的介入封堵治疗。先后承担国家级科研课题4项，省市级科研课题10余项，每年在国、内外期刊发表高质量科研论文10余篇，每年主办金陵儿童心脏病论坛暨国家级继续教育学习班。