东部战区总医院口腔科，是南京市口腔医学专业委员会副主任委员和硕士研究生培养单位。现有在职人员37名，其中主任医师2名，副主任医师5名,博士后1名，博士7名，硕士8名。下设口腔内科、口腔颌面外科、口腔修复科和口腔正畸科等4个专科。包括口腔门诊和口腔颌面外科病房两部分。口腔门诊展开口腔综合治疗台25张，口腔颌面外科病房为独立的病区，展开病床22张。全科具有进口精密铸造机、研磨机、数字化全景机、微动力系统等先进的口腔医疗设备。
获国家自然科学基金在内的多项课题，每年发表研究论文20-30篇，先后获科技进步三等奖10余项。口腔内科是口腔医学中最主要的组成部分，口腔内科的主要疾病有龋病、牙体硬组织病、牙髓病、根尖周病、牙周病和粘膜病。龋病即俗称的“虫牙”，是由细菌和食物等原因所致的牙体硬组织脱矿软化，早期无自觉症状，后期可有冷热刺激疼痛等症状，牙冠出现窝洞；牙体硬组织病是非龋性的牙体硬组织缺损，包括外伤牙折、牙颈部楔状缺损等。
牙髓病多由前两种疾病发展而来，可发生剧烈疼痛；根尖周病多由牙髓病发展而来，临床上急性期可出现局部肿胀疼痛，慢性期可出现牙龈窦道；牙周病为牙齿周围组织的疾病，可有牙龈出血、牙松动、肿痛等症状；粘膜病主要是发生在口腔粘膜上的疾病，常见的有复发性口腔溃疡、口腔扁平苔藓等。
口腔内科疾病大都可以通过治疗痊愈，预防和早期治疗特别重要，目前口腔内科有先进的综合治疗台7台，都配备有光固化灯和洁牙机头，除传统的治疗方法以外，引进了国外先进的充填材料和治疗仪器，如前后牙的纳米树脂充填材料，充填后的牙齿具有非常好的美观性和耐磨性，可以达到以假乱真的地步；用于根管治疗的镍钛根管锉，可成功治疗后牙细弯根管，热牙胶充填仪可提高根管充填的密合度，提高治疗的成功率。
目前口腔内科有高级职称医师2名，中级职称医师3名，其中博士2名，硕士1名，都具有丰富的临床工作经验和精湛的临床操作技能，每年培养各医学院校实习生及进修生10余名。
口腔颌面外科包括门诊和病房两部分。病房展开床位22张，是江苏省综合性医院中开展床位数和年收治病员数最多的单位。在口腔颌面部良性和恶性肿瘤的手术治疗、颌面部创伤救治、血管瘤和脉管畸形的综合治疗、唇腭裂序列治疗、牙颌面畸形手术整复和复杂牙拔除等方面积累了丰富的经验。
尤其在口腔颌面部恶性肿瘤的根治性手术及遗留缺损的组织瓣修复、颌面部创伤救治及血管瘤和脉管畸形的综合治疗等方面达到国内一流水平。目前拥有专业人员7名，包括主任医师2名、副主任医师2名、主治医师3名。
东部战区总医院口腔科比较有特色的主要有：
1、前牙缺损、缺失或畸形的美容修复，尤其采用了国际上非常先进的修复技术如贵金属烤瓷、纯钛烤瓷、铸瓷或全瓷技术等，可实现美观、功能和生物相容性俱佳的完美结合，达到最佳的修复效果。
2、残根、残冠的保存修复，在前、后牙患牙完善根管治疗的基础上，采用各种核桩技术最大程度地保存患牙，恢复美观和咀嚼功能。
3、老年人严重复杂缺牙的修复以及咬合重建等。
4、颞下颌关节紊乱综合症和夜磨牙的修复治疗。
5、口腔矫治器治疗阻塞性睡眠呼吸暂停、低通气综合症。
6、口腔正畸是口腔科的重要组成部分，主要处理口腔各种错牙合畸形的预防及矫治。
错牙合畸形是指儿童生长发育过程中，由遗传的或环境因素（如疾病、口腔不良习惯、替牙异常）等引起的牙齿、牙弓、颌骨以及颅面的异常（如牙排列不齐、上下牙弓间的咬合关系异常、颌骨大小、位置、形态异常等）。错牙合畸形可表现为：个别牙错位；牙弓形态和牙齿排列异常如牙列拥挤等；牙弓、颌骨、颅面关系异常：如反牙合（地包天），上颌前突（暴牙，开唇露齿）。
错合畸形具有很大的危害性：
1、影响颜面部软硬组织的正常发育。
2、影响口腔健康，易发生龋病及牙周病。
3、影响咀嚼、呼吸、发音等口腔功能。
4、影响容貌美观。
错牙合畸形的矫治：根据不同情况采用功能矫治器、活动矫治器，各种固定矫治器治疗。活动矫治器，矫治乳牙、替牙期牙列反牙合，不良习惯的破除等；固定矫治器（各种方丝弓、直丝弓矫治技术），用于恒牙期各类错牙合畸形的矫治，具有疗程相对短，复诊间隔时间长，治疗效果优良的特点。
医院口腔正畸科现有高级职称人员1人，正畸专业毕业硕士2人，中华口腔正畸专业医学会会员，国际正畸联合会会员。已经完成固定矫治病例3000余，活动矫治及其它病例若干，治疗效果优良，在南京地区享有较高的知名度。现代化治疗设备配套齐全，拥有国际先进的牙科综合治疗台及消毒设备。治疗用耗材可根据患者的愿望自主选择各种价位的进口或国产材料。矫治技术先进,目前开展的矫治方法包括国际公认及流行的各种活动矫治方法、各种固定矫治方法。
能够完成青少年及成人的各种类型错合畸形的矫治，与正颌外科联合矫治，复杂的骨性错合畸形，并开展了修复治疗前矫治及部分适合正畸治疗的牙周病治疗，部分创伤后的美容治疗等疑难病例的治疗也积累了丰富的经验。已经形成包括矫治前、矫治中、矫治后的一套完整的治疗体系。每年接收多名高年资临床医师学习深造。