南京医科大学第一附属医院耳鼻咽喉科，始建于1939年，其前身为国立江苏医学院附设医院耳鼻喉科。经过八十多年的探索和开拓，几代人的奋斗和拼搏，在耳鼻咽喉-头颈外科领域医疗、教学和科研方面取得了长足的发展。

该科是南京医科大学耳鼻咽喉科学博士学位和硕士学位授权点，江苏省耳鼻咽喉科医疗质量控制中心挂靠单位，江苏省临床重点专科，江苏省135工程医学重点学科，江苏省科教兴卫工程医学重点学科，世界卫生组织预防聋和听力减退合作中心，HI-IFOS-ISA江苏耳科与听力中心，江苏省耳科疾病与听力障碍诊治中心，南京医科大学国际变态反应研究中心，并且是国家首批住院医师规范化培训耳鼻咽喉科专业基地，中国医师协会住院医师规范化培训耳鼻咽喉科专业骨干师资培训基地。

中国医师协会内镜培训基地，耳鼻咽喉科专业国家药物临床试验机构，国家耳鼻咽喉疾病临床医学研究中心核心合作单位，全国耳鼻咽喉科临床质量控制中心成员单位，全国耳鼻咽喉头颈外科联盟成员单位，长三角城市群耳鼻咽喉头颈外科协同发展战略联盟主席单位。2021年，耳鼻咽喉科护理组荣获共青团中央和国家卫生健康委颁授的第20届全国青年文明号荣誉称号。