北京市海淀医院消化内科成立于建院伊始，2005年独立成科，现已开展消化内科病房、门诊及内窥镜中心等相关工作。近年来尤以与北医三院深度融合为契机，科室综合实力得到快速提升，成功跻身为院内重点学科，培养并建立了一支技艺精湛，作风优良的专业队伍，形成了集医疗、教学、科研于一体的综合性学科。目前科室拥有主任医师3名，副主任医师7名，主治医师3名，住院医师3名，其中，硕士以上学位12人。病房开放床位33张，年门诊量十余万人次，门诊设有普通专业门诊和专家门诊，周末设有半天普通门诊。针对目前疾病谱的变化，开展了胃食管反流病、脂肪肝、幽门螺杆菌等专科特色门诊。诊治范围涵盖各种消化系统常见、多发疾病及各种疑难及危急重症，如胃食管反流病、萎缩性胃炎、消化性溃疡、炎症性肠病、各种肝病（病毒性肝炎、酒精性肝病、自身免疫性肝病、药物性肝损伤、肝昏迷等）、肝硬化、消化道肿瘤、胆道结石、胰腺炎、消化道出血、难治性腹水、功能性胃肠病及肠内肠外营养等。内镜中心年内镜量超13000人次，有独立操作间5间，完善的消毒系统，多种先进设备，富士能及奥林巴斯电子胃肠镜、电子放大内镜、电子超声胃镜、胶囊内镜、超细经鼻胃镜、13C（检测幽门螺杆菌）频谱分析仪等。除常规胃镜、肠镜检查外，在区域内率先开展经鼻内镜检查，大大减小了患者接受胃镜检查的痛苦。近年来又开展了精查内镜、胶囊内镜，无痛胃肠镜等检查；碳13尿素呼吸试验（检测幽门螺杆菌）；各种肿瘤抗原的检查如CA199、CA125、CEA；PCR技术的临床应用如乙肝病毒的检测；胃肠道粘膜活检病理检查等。此外还有多项特色诊疗技术，包括电子染色及化学染色内镜检查、超声内镜、消化道息肉摘除术、急诊胃肠镜止血、消化道异物取出术、食管胃底静脉曲张硬化治疗术及套扎术、内镜下逆行性胰胆管造影及胆管取石术、消化道支架置放术、食管狭窄扩张术、空肠上段置管及小肠气钡双重造影等。海淀医院消化内科近年来在消化道肿瘤的早期筛查方面作了大量的工作，指导组织周边多所高校开展大肠癌筛查工作，有效地降低了目标人群的大肠癌发病率，取得了较大的社会效益，完成市级、区级课题多项，在大肠癌筛查网络建设方面处于国内领先水平。消化内科近年来先后承担了首都医科大学、民族大学医学院，南昌大学医学部及北京中医药大学等多所高校医学生的临床实习及见习工作，承担全科住院医师培训及研究生培养，各基层医院消化内科医生的继续教育工作及进修工作。2014年海淀医院与北医三院深度融合以来，更加注重科学研究，承担多项院内外科研课题。参与编写多种书籍，每年发表论文10余篇。并由知名专家北医三院消化科主任周丽雅教授任学科带头人，由北医三院消化科副主任丁士刚教授担任副院长，此外北医三院多名专家长期在科室指导工作，积极推进内镜下疑难息肉切除、ERCP、ESD、消化道支架置放术等先进技术操作，使科室对疑难危重病例的诊治水平有了进一步的提高。