广东医科大学附属医院儿童医学中心于1964年筹建病房，是广东省粤西地区最大的儿童保健和疾病诊疗中心、儿科医师培训基地，承担了粤西地区2010年1月广东医学院附属医院命名为“广东医学院附属医院儿童医学中心”。中心设有4个病区，包括神经、泌尿、内分泌、心血管、消化、呼吸、血液、新生儿、重症监护等专业，共有床位157张。具有先进的仪器设备，包括呼吸机16台、纤维支气管镜4套、肺功能检测仪2台、儿童胃镜1条、脑电图4台、CRRT1台、层流床12张等，新生儿重症监护病房备有新生儿辐射台11张，新生儿暖箱30台，新生儿蓝光治疗仪3台，脑干听觉诱发筛查仪1台等。中心备有儿科病人救护车2辆，方便病人检查及门诊病房间转运。2012年新生儿专科获省级重点专科，血液病专科获广东省农村儿童白血病定点医疗单位。门急诊特点及年门急诊量儿童医学中心门急诊分四个部分：急诊：24小时开诊，具有完善的急救设备和急危重病人转运能力，年急诊量约17万人次；普通儿童门诊：每天均有5～6名专家出诊，日门诊量约400人次，开设哮喘、消化、血液和心血管等病人专科门诊；脑康复／癫痫专科门诊：每天有2名专家出诊，有12名康复技师，开展运动治疗、语言治疗、针灸、理疗等康复治疗手段，是粤西地区规模最大、康复技术最全面的儿童脑和神经康复中心；新生儿（早产儿）保健及行为发育门诊：有3名专家出诊，主诊早产儿随访、行为发育异常如自闭症、多动症儿童的评估和治疗。目前医学中心医疗能力儿童医学中心具备完善的医疗条件，先后开展的先天性心脏病介入治疗、儿童肺功能检测、儿童纤维支气管镜检查术、呼吸及辅助呼吸治疗、肠道外营养、血液净化、腹膜透析等诊疗技术均在粤西地区领先水平，省内先进水平。人才培养方面儿童医学中心拥有一支高素质的人才队伍，科室共有医疗专业人员165名，护士106名，技术人员14名。医疗人员中包括主任医师8名，副主任医师7名，主治医师10名，住院医师11名，拥有硕士生导师4名，博士学位获得者3人，硕士21人。儿童医学中心每年为医学院培养硕士研究生10-14名，已培养儿科学硕士研究生100多名，积累了丰富的研究生培养和管理经验。2000年儿科学被评定为广东医学院院级重点支持学科，2005年被评定为院级精品课程及优秀课程。获南粤优秀教师称号2人，“千百十工程”院级重点教师5人，院级名师2人。学术队伍的年龄结构、知识结构和职称结构合理，学术队伍团结协作，学术思想端正、活跃，能持续不断地进行高水平的教学和研究工作。目前医学中心科研能力科室学术气氛浓厚，学科点自从建立以来，就确定了以科研为龙头，带动医疗和教学全面发展的方针，目前形成了一定的学科规模和特色、优势：学科建成了以小儿心脏病、血液病、呼吸疾病、新生儿及危重症、儿童保健康复等专业为龙头的儿童预防保健-医疗-康复一体化的儿童医学中心。学科形成了以肺动脉高压、血液病的防治、新生儿及危重症、小儿呼吸系统疾病和儿童保健康复等稳定的科研方向，近年来投入大量的人力、物力，科研成果硕果累累，近5年以来主持国家、省级课题共5项。SCI论文11篇，单篇最高IF=3.948。主编及参编国家级规划教材1部，著作1部，主译1部。地区影响力儿科呼吸是粤西地区儿科重点亚专科之一，对儿童各种呼吸系统疾病的诊治有深入的研究和丰富的临床经验，在呼吸系统疑难及少见病的诊治方面尤为突出，主要承担各种呼吸道感染、支气管哮喘、慢性咳嗽、婴幼儿喘息性疾病等常见呼吸系统疾病的诊治，及肺部先天性或疑难病例的诊断、治疗与随访，同时开展哮喘儿童及家长的自我管理教育、哮喘知识讲座。儿童血液是粤西地区最大、技术力量最强的儿童专科，获广东省农村儿童白血病定点医疗单位。PICU\NICU是粤西地区技术力量最强的专科，承担极低/超低早产儿的救治及危重症患儿的诊治工作，定期开展新生儿复苏培训班、机械通气治疗培训班等。儿童内分泌、风湿免疫专科等是本地区优势儿童亚专科。