广东医科大学附属医院胃肠外科是广东医科大学第一批硕士点，是广东省临床重点专科。现有病床66张，目前分胃肠组、大肠组、肛肠与炎性肠病组。科室现有医师15人，正高职称2人，其中硕士导师1人；副高职称5人；具备硕士学历11人，其中5人在读在职博士学位。科室还有一支由19人组成的高素质的护理队伍。在学科带头人许庆文教授的带领下，胃肠外科率先引进加速康复外科理念，在追求给病人最先进医疗技术的同时重视对病人的人文关怀，让病人得到最大程度的康复。目前在结肠癌根治术中应用加速康复外科已取得初步成果。胃肠外科拥有强大的技术团队，在粤西地区率先开展全胃切除、间置空肠代胃术，大肠癌术中门静脉插管化疗，直肠癌TME手术，超低位直肠癌保肛手术，腹腔镜胃肠肿瘤根治术等。近年来还先后开展腹腔镜胃癌根治毕Ⅰ式三角吻合术、胃癌根治Uncut-Roux-en-Y吻合术，结肠癌CEM手术，直肠癌根治保留邓氏筋膜手术、胃减容手术、低位直肠癌腹腔镜辅助TaTME手术等多种新术式以及结肠癌新辅助化疗等。对炎性肠病、肠瘘、急腹症及肠梗阻等疑难重症的诊治及抢救有丰富的经验。学科诊疗水平达到省内乃至国内先进水平，在粤西地区处于领先地位，享有较高声誉。科室同时开设肛肠外科手术室和伤口、造口专科门诊。建立胃肠肿瘤MDT团队和ERAS团队，方便患者就医和解决疑难问题，医疗质量和病人满意度不断提高。科室十分重视人才梯队的建设和人才培养工作，有6人通过进修学习成为技术骨干，7人参加在职博士学习，其中2人已顺利毕业取得博士学位。承担广东医科大学外科学总论及普通外科教学任务，是硕士研究生培养点。承担国家卫生计生委科研项目3项，广东省卫生计生委科研项目1项，湛江市科技攻关科研项目2项，获资助科研经费近百万元；获湛江市科技进步奖二等奖2项；获湛江市科技进步奖三等奖2项。