北京大学深圳医院男科，成立于2001年，2006年入选深圳市重点实验室，2008年入选广东省重点实验室。目前实验室总面识2000平方米，拥有1000万元的科研设备，包括荧光定量PCR仪、基因芯片妇描仪、冰冻初片机、凝胶成像分析系统、病理图像分析系统、化学发光和荧光扫描仪、化学发光和茭光检测仪等大型设备，以及各种PCR仪、显微镜、离心机、电泳装置、冰箱、细胞培养和细菌培养等常用的细胞与分子生物学设备。

实验室现有研究人员21名，其中实验研究人员15名，临床研究人员6名，研究员、主任医师或主任技师5名，其中博士生导师1名，副研究员、副主任医师或副主任技师名。现有在站博士后、在读博士或硕士研究生12名。

近五年来，实验室在精子发生的基因表达与调节、男性不育症的分子机理和泌尿生殖系统恶性肿瘤的基因组学研究等方面取得较好成绩：承祖各级科研项目28项，其中国家重大科学研究计划子课题1项，国家自然科学基金11项，共发表SC论文68篇，获得省部级科研成果奖3项，“泌尿系统恶性肿瘤的基因组学研究”分别获得2014年中华医学科技二等奖、2015年广东省自然科学一等奖和教育部自然科学二等奖。