航天中心医院胸外科成立于1979年，2012年人才引进学科带头人窦学军主任后，目前已形成以微创手术为特色的综合治疗胸部肿瘤（肺癌、食管癌、纵隔肿瘤、胸腔巨大肿瘤等）为主要业务的科室，创建加速康复病房(ERAS），纯腔镜微创手术达到90%以上，独立开展单孔胸腔镜下肺叶/肺段切除术、食管癌根治术等本专业共识的顶级微创手术。科室团队目前胸外科拥有一支技术精湛、作风过硬、爱岗敬业、朝气蓬勃的人才队伍，共有医生9名，全都具备硕士研究生学历，高级职称4名，中级职称2名。学科带头人窦学军，胸外科科主任，主任医师，北京大学副教授，担任北京市医学会胸外科分会委员、北京抗癌协会食管癌专业委员会委员等，荣获第八届北京优秀医师荣誉称号。科室建设科室目前常规开展单孔胸腔镜下肺叶/肺段切除术、胸腔镜下肺袖状切除、颈胸腹三切口食管癌根治术、全腔镜下食管癌切除食管胃右胸内吻合术、经剑突单孔胸腔镜下纵隔肿瘤切除术、胸腔巨大肿瘤切除术等复杂疑难手术，技术处于国内领先水平。在早期肺癌微创手术治疗及可手术的中晚期肺癌综合治疗方面凸显学科水平和特色。CT引导下肺穿刺活检、肺癌射频消融等技术全面开展。每周一下午的肺小结节多学科联合门诊，大大提高了早期肺癌的诊断率，恶性肿瘤诊断准确率达95%以上。科室还与301医院、北京大学肿瘤医院等知名专家以及国际单孔胸腔镜手术创始人进行学术交流、手术演示，进一步加强业务合作，不断提高学科水平。在肺癌、食管癌等胸部肿瘤治疗上，结合疾病分期及患者身体状况，给予手术、化疗、放疗、靶向治疗、免疫治疗等综合治疗，为患者制定最优的治疗方案，大大提高了中晚期肿瘤患者的生存率。教学科研科室有北京大学副教授一名，担任北京大学医学部八年制博士基础班学生胸外科大课教学，北医本科及港澳台6年制学生教学、实习工作。科室参与多项国家级、省部级和集团课题，发表核心期刊及SCI论文数十篇。