上海市宝山区中西医结合医院肛肠科为“上海市中医药临床重点学科”。该科继承了沪上著名顾氏、夏氏外科的学术经验，同时在科室肖秀丽主任的带领和科室成员的共同努力下，成为覆盖宝山区，以及周边区域的具有较强影响力的特色优势学科。
2012年肛肠科被评为上海市中医药临床重点学科。通过一年的重点学科建设，肛肠科目前拥有住院病床20张，同时开设有普通门诊及专家门诊，并配备有肛肠综合治疗仪、超声雾化熏洗仪、智能肛周熏洗仪、中药熏蒸汽自控治疗仪、多频微波治疗仪、高频电刀等先进设备。2013年9月搬至崭新的东院病房，并配备有专科手术室，手术室设备先进。
　　科室重视整体发展，临床与科研紧密结合，在发挥中医治疗特色的前提下，积极结合现代医学知识，兼收并蓄，目前已形成了“混合痔、肛瘘、肛裂”三大特色优势病种。手术方式采取“微创”与“无痛”相结合，既提高了手术疗效又明显减轻了患者痛苦；针对围手术期创面采用科室自制制剂“生肌散”、“八宝丹”等自制中药换药，可有效促进术后创面愈合。
　　肛肠科拥有临床经验丰富的专家、博士、硕士等组成的人才梯队；高素质的医护队伍。科主任肖秀丽博士分别师从全国名老中医学术继承人导师、上海市名中医唐汉钧教授和上海中医药大学中医皮肤科学科带头人李斌教授。先后获得宝山区第七批“青年尖子”；医院突出贡献奖等多项荣誉称号。现担任中华中医药学会肛肠分会常务理事、全国中医药高等教育学会临床教育研究会肛肠分会常务理事、上海中西医结合学会大肠肛门病专业委员会委员，上海市中医药学会肛肠分会委员，上海市中医药学会外科分会委员，上海市中医药学会皮肤科分会委员等多个学术社会兼职，在治疗中医外科疾病肛肠疾病方面已形成具有自己特色的理、法、方、药体系。并承担多项科研课题。吴海蓓主治医师，长期从事肛肠科临床，擅长各类痔疮的诊断及手术治疗。张海岩主治医师为肛肠科临床骨干擅长便秘的中医药治疗。

　　肛肠科全科人员近年来主持、参与、完成各项课题8项，并获得省、市级多项成果奖励；近五年在各级期刊杂志发表论文30余篇，其中核心期刊10余篇。
　　肛肠科以人才为纽带，临床与科研相辅相成、相得益彰。临床为科研提供了研究方向和样本，临床是对科研成果的最好检验。而科研为临床提供了新的理论、新的方法，提高了临床医生的业务水平。