上海交通大学医学院附属同仁医院肿瘤科是由国内着名消化肿瘤专家郭孝达主任创建于1978年，是上海市综合性医院创建最早的肿瘤专科之一。

作为医院重点学科的核心骨干科室之一，承前启后，医院先后从上海交通大学医学院附属仁济医院和上海交通大学附属第六人民医院引进马俐君教授和张剑军教授担任科主任，在医院领导的关心支持下，带领科室全体医护进一步拓展了业务范围，提升了整体诊疗水平，建成了学术梯队完整的集医疗、教学、科研于一体的肿瘤专科，在同类同级别医院中评比中名列前茅。

科室专注于消化系统恶性肿瘤（结直肠癌、胃癌、食管癌、胰腺癌、肝癌等）、骨与软组织肉瘤和骨转移癌以及肺癌、乳腺癌等常见肿瘤的规范化、个体化、精准化临床诊疗。科室共设置1个病区和1个日间化疗病房，拥有固定床位39张，年门诊量达13000人次，出院达3000余人次。

科室拥有上海交通大学医学院硕士研究生导师2人，纳米技术及应用国家工程研究中心博士导师1名，高级职称4人，中级职称3人，住院医师3人，护理人员14人，医生硕博士比例达90%。科室为上海交通大学转化医学研究院临床转化基地，将最前沿的研究成果更高效地转化到临床实践中，为患者提供最佳的治疗方案。