上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心神经内科，是全国成立最早的儿科神经专业之一，主要从事0-18周岁儿童和青少年神经系统各类疾病的临床医疗、教学和科研工作。目前是中国抗癫痫协会理事、中国抗癫痫协会生酮饮食专业委员会副主任委员、中国抗癫痫协会精准医学与药物不良反应监测专业委员会和结节性硬化专业委员会委员、中华医学会儿科专业委员会神经学组委员、中国医师协会神经科专业委员会儿科神经学组委员、上海市抗癫痫协会理事、上海市医学会儿科专业委员会神经学组副组长等单位，也是上海市住院医师规范化培训基地和上海市专科医师培训基地（儿童神经科）。

科室现有门诊、病房（21张床位，包括视频脑电图监测床位）、脑电图室和肌电图室。科室成员包括神经内科医师12名（其中，主任医师1名、退休返聘主任医师2名、主治医师3名、住院医师6名），脑电图室工作人员4名（其中1名副主任医师，3名技术员）。

诊治疾病主要包括：

热性惊厥、胃肠炎伴惊厥、癫痫等各种惊厥性疾病，抽动症、头痛头晕等发作性疾病，病毒性脑炎、化脓性和真菌性脑膜炎、免疫性脑炎及感染相关性脑病，重症肌无力，脑性瘫痪及其他类型瘫痪，智力、运动、语言发育落后，肌营养不良等肌肉病，线粒体脑肌病等。

2012年3月成立“儿童癫痫诊治中心”，由神经内科、神经外科联手，影像科、发育行为儿科、药剂科、遗传科等多学科参与组成。通过疾病诊疗的一站式和多学科协作模式，优化诊疗流程，为病人提供最佳化的治疗和便利。开展有ACTH治疗婴儿痉挛症、生酮饮食治疗与管理、雷帕霉素治疗结节性硬化和癫痫手术治疗，为患儿取得较满意疗效。二十余年来儿中心神经内科在临床服务、科研教学、人才培养等方面辛勤耕耘，取得了显著的成绩，在解决罕见疑难病例的诊断和治疗上发挥了出色的作用。