上海市东方医院甲状腺外科设本部甲状腺外科和南院甲状腺乳腺外科，共有床位24张。

科室能够独立开展乳腺甲状腺的所有常规手术，在乳腺良性肿瘤的微创治疗和甲状腺良性结节的微波消融治疗上有丰富的经验；科室每年门诊量38000多人次，手术量1000余人次。科室紧跟学科发展前沿，秉持“以病人利益为中心，技术上精益求精”的精神，以“专业、细致、认真、真诚”为服务理念，竭尽全力以先进的技术和浓厚的人文关怀为每一位患者提供服务，让每一位经治患者能够达到躯体和心理上的康复。