北京航天总医院血管外科组建于二十世纪九十年代，是北京市早期开展血管外科工作的单位之一，目前有病床36张，共有医护人员22人，其中医生10人，护士12人，高级技术职称5人，中级技术职称5人。2012年，总医院聘请北京协和医院血管外科吴继东教授担任血管外科主任。

吴继东教授有着多年从事血管外科医、教、研工作经验，熟悉各部位血管病变，经验丰富，手术技巧强。目前血管外科在胸、腹主动脉瘤以及夹层动脉瘤的腔内治疗等许多方面达到了国内先进水平。

在南城地区率先开展糖尿病足血管病变的介入治疗和腔内技术联合外科手术治疗多节段动脉硬化闭塞症取得优异成绩。

在颈动脉狭窄内膜剥脱术、锁骨下动脉窃血综合征、肾动脉狭窄的腔内治疗以及下肢动脉硬化闭塞症外科手术和微创治疗、大小隐静脉曲张的手术治疗、急性血管损伤的手术治疗方面，都积累了丰富的临床经验。

在静脉血栓栓塞疾病、门脉高压症、布加氏综合征的外科治疗方面取得了很好的成绩。