北京航天总医院感染科现有医护人员13人，其中副主任医师4名，主治医师2名，在感染性疾病及传染性疾病的诊断、治疗、护理方面具有丰富的专业知识及临床经验，主要诊治各种急慢性病毒性肝炎、肺结核及肠道传染病。

近年来开展抗HBV主动免疫疗法治疗慢性乙肝取得较好疗效，引进淋巴细胞培养-γ干扰素释放试验，对结核感染提供诊断依据。

感染科年门诊量2万人次，发热门诊长期开诊，成为SARS、人感染禽流感等新发呼吸道疾病的前沿哨所。