甲状腺过氧化物酶抗体高目前并没有太好的治疗方法。有研究发现补硒治疗部分患者有效。可以口服硒酵母片或硒酵母胶囊。治疗3月后复查甲状腺过氧化物酶抗体，如果有明显下降，建议继续服用一段时间，否则可以考虑停用。需要注意至少每年复查一次甲状腺功能，甲状腺过氧化物酶抗体高的患者容易出现甲状腺功能减退。平时生活中注意不要摄入太多海产品，比如海带、紫菜、虾皮等。

甲亢的治疗方法主要包括三种：药物、放射性碘131、手术，需根据情况选择。药物适合大多数患者，可能实现治愈停药，但疗程长，有可能造成肝功异常及粒细胞减少。治疗过程繁琐，需要频繁复查，并且停药后有一定的复发概率。放射性碘131方便、快捷、经济、有效，但治疗后容易出现终身性甲减。手术治疗适合少部分患者，比如甲亢合并甲状腺恶性肿瘤者等。