感染病医学部编设感染性疾病和生物损伤救治２个亚专科、１个研究所和1个呼吸与危重症医学科，共有各类人员294名。学部由中国科学院院士王福生主任领衔，拥有军内外知名的感染病、呼吸病和重症医学等领域的专家团队。

感染病医学部承担国家和军队重大感染性疾病的临床诊治、教学训练、转化研究和成果推广等任务，同时在全军重大传染病防控、生物安全和重大疫情处置中发挥不可或缺的战略保障力量，在新突发传染病以及相关的危重疑难疾病的临床救治，特别是在细胞治疗领域处于国际前沿水平。

学部是国家自然科学基金创新群体、国家感染性疾病临床医学研究中心，建有全军传染病研究所、全军艾滋病和肝病防治重点实验室、全军新突发传染病防治实验室，是全军“双重”建设单位。感染病医学部将努力建设成为国际一流、国内顶尖、临床与科研相结合、平时与战时紧密衔接的研究型感染病学科。